Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb4Q02738 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms