Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HmgcrQ01237 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms