Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms