Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GabpaQ00422 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GabpaQ00422 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms