Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pou1f1Q00286 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pou1f1Q00286 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pou1f1Q00286 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou1f1Q00286 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pou1f1Q00286 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pou1f1Q00286 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pou1f1Q00286 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pou1f1Q00286 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou1f1Q00286 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms