Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psme1P97371 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme1P97371 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms