Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CiitaP79621 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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