Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NficP70255 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NficP70255 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NficP70255 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms