Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Traf5P70191 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms