Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms