Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Usp46P62069 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp46P62069 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp46P62069 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp46P62069 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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