Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms