Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppfia3P60469 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms