Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctdsp1P58466 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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