Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Dpf3P58269 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dpf3P58269 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Dpf3P58269 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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