Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bace1P56818 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms