Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms