Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtshP49935 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtshP49935 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtshP49935 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtshP49935 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms