Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl13P47963 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms