Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gli1P47806 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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