Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrprbP47758 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrprbP47758 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SrprbP47758 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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