Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms