Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms