Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sdc2P43407 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sdc2P43407 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sdc2P43407 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sdc2P43407 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sdc2P43407 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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