Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mmp9P41245 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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