Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VhlP40338 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
VhlP40338 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VhlP40338 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms