Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms