Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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