Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc5P32043 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc5P32043 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms