Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tacr1P30548 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms