Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcdP28867 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcdP28867 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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