Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RxraP28700 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RxraP28700 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxraP28700 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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