Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sept4P28661 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sept4P28661 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sept4P28661 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sept4P28661 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sept4P28661 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sept4P28661 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sept4P28661 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sept4P28661 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sept4P28661 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sept4P28661 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sept4P28661 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sept4P28661 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sept4P28661 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sept4P28661 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms