Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb1P28230 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms