Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pde6aP27664 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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