Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rpl3P27659 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rpl3P27659 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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