Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NfyaP23708 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NfyaP23708 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms