Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde6bP23440 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms