Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PparaP23204 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PparaP23204 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PparaP23204 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PparaP23204 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms