Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RarbP22605 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RarbP22605 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RarbP22605 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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