Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmnb2P21619 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms