Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms