Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms