Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NefhP19246 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms