Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P18533 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P18533 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P18533 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P18533 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18533 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms