Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P18528 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18528 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18528 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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