Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpraP18052 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms