Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Calb1P12658 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Calb1P12658 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Calb1P12658 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Calb1P12658 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Calb1P12658 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Calb1P12658 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Calb1P12658 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Calb1P12658 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Calb1P12658 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Calb1P12658 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Calb1P12658 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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