Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms