Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PolP10400 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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